2024年6月17日上午,美国佐治亚理工学院张秀苇博士应国家数学与交叉科学中心邀请做客青年论坛,并做了题为“通过多条件和空间信息研究单细胞”的学术报告,来自院内外50多位师生参加了本次报告会。
报告中,张秀苇博士首先指出,随着单细胞测序技术的发展,人们可以对细胞多模态数据进行采集,并获得越来越多的个体样本的数据。接着,张博士介绍了其课题组开发的scDisInFact方法,该方法能够对多批次、多条件单细胞转录组学数据集进行有效的解纠缠,并预测未知条件下的数据。进一步,张博士介绍了其课题组针对空间转录组学数据开发的几种方法,包括学习细胞-细胞相互作用的CLARIFY方法、基于细胞转录组学和位置学习细胞联合嵌入的scHybridNMF方法等。最后,张博士介绍了其课题组开发的用于评估多组学数据和空间数据的模拟器——scMultiSim。报告过程中,师生们与张博士进行了充分与深入的讨论和交流。
张秀苇博士目前是佐治亚理工学院计算科学与工程学院的J.Z. Liang Early Career Chair助理教授。她于瑞士洛桑联邦理工学院获得计算机科学博士学位,并曾在英国剑桥大学和加州大学伯克利分校等从事博士后研究。她的研究重点是开发单细胞基因组学和空间数据的分析方法,包括细胞时序动态方法、多模态数据整合方法、以及分子间相互作用推断方法等。